siggenes

DOI:10.18129 / B9.bioc.siggenes

使用SAM和Efron的经验贝叶斯方法进行多重测试

Bioconductor版本:Release (3.6)

利用微阵列显著性分析(SAM)和经验贝叶斯微阵列分析(EBAM)鉴定差异表达基因和估计错误发现率(FDR)。

作者:Holger Schwender

维护者:Holger Schwender < Holger。SCHW在gmx.de>

引文(从R内,输入引用(“siggenes”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“siggenes”)

文档

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browseVignettes(“siggenes”)

PDF R脚本 siggenes手册
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpressionExonArrayGeneExpression微阵列MultipleComparison单核苷酸多态性软件
版本 1.52.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 13年)
许可证 LGPL (>= 2)
取决于 方法,Biobase,样条,图形
进口 stats4
链接
建议 affy注释genefilterKernSmoothscrime(> = 1.2.5)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 KCsmartoneChannelGUI
进口我 魅力coexnetDAPARDeSousa2013GeneSelectorminfiXDE
建议我 GeneSelectorlogicFS三人组
构建报告

包档案

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源包 siggenes_1.52.0.tar.gz
Windows二进制 siggenes_1.52.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) siggenes_1.52.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/siggenes
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/siggenes/
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