sigPathway

DOI:10.18129 / B9.bioc.sigPathway

路径分析

Bioconductor版本:版本(3.6)

进行路径分析,计算中描述的NT_k和NE_k统计田et al . (2005)

作者:Weil赖(R和C代码优化),陆田和彼得公园(R算法开发和初始代码)

维修工:Weil赖< wlai alum.mit.edu >

从内部引用(R,回车引用(“sigPathway”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“sigPathway”)

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browseVignettes (“sigPathway”)

PDF R脚本 sigPathway
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpression,MultipleComparison,软件
版本 1.46.0
Bioconductor自 BioC 1.9 (r - 2.4)(11.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 2.10)
进口
链接
建议 hgu133a.db(> = 1.10.0),XML(1.6 > = 3),AnnotationDbi(> = 1.3.12)
SystemRequirements
增强了
URL http://www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.0506577102http://www.chip.org/ ppark /补充/ PNAS05.html
取决于我 tRanslatome
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 sigPathway_1.46.0.tar.gz
Windows二进制 sigPathway_1.46.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) sigPathway_1.46.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sigPathway
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/sigPathway/
包下载报告 下载数据

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