seqPattern

DOI:10.18129 / B9.bioc.seqPattern

在一组排序序列中可视化寡核苷酸模式和基序出现

Bioconductor版本:Release (3.6)

可视化寡核苷酸模式和序列基序出现在一个公共参考点中心的大序列集，并根据用户定义的特征进行排序。

作者:Vanja Haberle < Vanja。Haberle在gmail.com>

维护者:Vanja Haberle < Vanja。Haberle在gmail.com>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“seqPattern”)

文档

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browseVignettes(“seqPattern”)

PDF	R脚本	seqPattern
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	SequenceMatching，软件，可视化
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.15.0)
进口	Biostrings，GenomicRanges，IRanges，KernSmooth，plotrix
链接
建议	BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7，篮球选手，RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了	平行
URL
全靠我
进口我	genomation
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	seqPattern_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	seqPattern_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	seqPattern_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqPattern
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/seqPattern/
软件包下载报告	下载数据