安全

DOI:10.18129 / B9.bioc.safe

意义的分析功能和表达

Bioconductor版本:版本(3.6)

安全是一个resampling-based方法检测基因表达的功能分类实验。安全可以应用于2-sample和多层次的比较,或简单线性回归。其他实验设计也可以适应通过用户定义的函数。

作者:威廉·t·巴里

维修工:威廉·t·巴里在jimmy.harvard.edu < bbarry >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“安全”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“安全”)

PDF	R脚本	安全手册
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneSetEnrichment,通路,软件,StatisticalMethod
版本	3.18.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 13年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> =测试盒框),AnnotationDbi,Biobase、方法、SparseM
进口
链接
建议	GO.db,PFAM.db,reactome.db,hgu133a.db,breastCancerUPP,生存,foreach,doRNG,Rgraphviz,GOstats
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	EGSEA,EnrichmentBrowser
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	safe_3.18.0.tar.gz
Windows二进制	safe_3.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	safe_3.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/safe
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/safe/
包下载报告	下载数据