rqt

DOI:10.18129 / B9.bioc.rqt

Rqt:用于基因级元分析的实用程序

Bioconductor版本:Release (3.6)

尽管现代GWAS方法近年来取得了一些进展，但如何计算整个基因的效应量和相应的p值仍然是一个重要的问题，而不是单个变异。R包rqt提供了基因水平的GWAS元分析。更多信息请参见:Lee等人(2016)的“下一代测序数据的基因集关联测试”，生物信息学，32(17)，i611-i619， ．

作者:I. Y.日班尼科夫，K. G.阿尔别夫，A. I.雅辛。

维护者:Ilya Y. Zhbannikov < Ilya。Zhbannikov在duke.edu>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rqt”)

文档

超文本标记语言	R脚本	rqt包的教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GenomeWideAssociation，PrincipalComponent，回归，测序，软件，StatisticalMethod，生存
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(1年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 3.4)，SummarizedExperiment
进口	统计数据,矩阵，ropls、方法、车，RUnit，metap，CompQuadForm，glmnet跑龙套,请
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/izhbannikov/rqt
BugReports	https://github.com/izhbannikov/rqt/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rqt_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	rqt_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rqt_1.4.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rqt
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rqt/
软件包下载报告	下载数据