rhdf5

DOI:10.18129 / B9.bioc.rhdf5

HDF5接口到R

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个包提供了HDF5和r之间的接口。HDF5的主要功能是能够通过完全可移植的文件格式在大容量存储(磁盘)上存储和访问非常大和/或复杂的数据集和各种各样的元数据。rhdf5包因此适合于在R和其他软件包之间交换大型和/或复杂的数据集，并允许R应用程序在比可用RAM更大的数据集上工作。

作者:Bernd Fischer [aut]， Gregoire Pau [aut]， Mike Smith [aut, cre]

维护者:Mike Smith < Mike。史密斯在embl.de>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rhdf5”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rhdf5”)

PDF	R脚本	rhdf5
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，基础设施，软件
版本	2.22.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 13年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法
进口	zlibbioc
链接
建议	bit64，BiocStyle，testthat
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL
全靠我	GSCA，HDF5Array
进口我	beachmat，biomformat，diffHic，DmelSGI，DOQTL，h5vc，电离，嘘，司康饼
建议我	激流回旋，SummarizedExperiment，tximport
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rhdf5_2.22.0.tar.gz
Windows二进制	rhdf5_2.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rhdf5_2.22.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhdf5
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rhdf5/
软件包下载报告	下载数据