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regsplice
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DOI:10.18129 / B9.bioc.regsplice
基于l1正则化的差分拼接检测方法
Bioconductor版本:Release (3.6)
在RNA-seq和外显子微阵列数据中检测差异剪接(差异外显子使用)的统计方法，使用l1正则化(套索)来提高功率。
作者:卢卡斯·m·韦伯[aut, cre]
维护者:Lukas M. Weber
引文(从R内，输入引用(“regsplice”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“regsplice”)
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“regsplice”)
| R脚本 | regsplice包的示例工作流 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，ExonArray，ExperimentalDesign，微阵列，RNASeq，测序，软件 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可 |
| 取决于 | |
| 进口 | glmnet，SummarizedExperiment，S4Vectors，limma，刨边机统计数据,pbapply， utils，方法 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/lmweber/regsplice |
| BugReports | https://github.com/lmweber/regsplice/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | regsplice_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | regsplice_1.4.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | regsplice_1.4.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regsplice |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/regsplice/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
