Bioconductor版本:Release (3.6)
regioneR提供了一个基于可定制排列测试的统计框架,以评估基因组区域集和其他基因组特征之间的关联。
作者:Anna Diez-Villanueva
维护者:Bernat Gel
引文(从R内,输入引用(“区域”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“regioneR”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“区域”)
R脚本 | 地区的装饰图案 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ChIPSeq,CopyNumberVariation,DNASeq,遗传学,MethylSeq,软件 |
版本 | 1.10.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(3年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | memoise,GenomicRanges,BSgenome,rtracklayer、并行 |
进口 | memoise,GenomicRanges,BSgenome,rtracklayer,并行,图形,统计,utils,方法,GenomeInfoDb,IRanges,S4Vectors |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | karyoploteR |
进口我 | annotatr,ChIPpeakAnno,karyoploteR |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | regioneR_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | regioneR_1.10.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | regioneR_1.10.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regioneR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/regioneR/ |
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