地区

DOI:10.18129 / B9.bioc.regioneR

基于排列试验的基因组区域关联分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

regioneR提供了一个基于可定制排列测试的统计框架,以评估基因组区域集和其他基因组特征之间的关联。

作者:Anna Diez-Villanueva , Roberto Malinverni 和Bernat Gel

维护者:Bernat Gel

引文(从R内,输入引用(“区域”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“regioneR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“区域”)

PDF R脚本 地区的装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeqCopyNumberVariationDNASeq遗传学MethylSeq软件
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 memoiseGenomicRangesBSgenomertracklayer、并行
进口 memoiseGenomicRangesBSgenomertracklayer,并行,图形,统计,utils,方法,GenomeInfoDbIRangesS4Vectors
链接
建议 BiocStyleknitrBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.maskedtestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 karyoploteR
进口我 annotatrChIPpeakAnnokaryoploteR
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 regioneR_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 regioneR_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) regioneR_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regioneR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/regioneR/
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