r3Cseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.r3Cseq

分析染色体构象捕获和下一代测序(3 c-seq)

Bioconductor版本:版本(3.6)

这个包是一个实现远程交互的数据分析从3 c-seq化验。

作者:Supat Thongjuea, MRC分子血液学单元,因此分子医学研究所、英国牛津大学< Supat。在ndcls.ox.ac.uk thongjuea >

维护人员:Supat Thongjuea < Supat。在ndcls.ox.ac.uk thongjuea >

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PDF	R脚本	r3Cseq
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文本		新闻

细节

biocViews	预处理,测序,软件
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	GenomicRanges,Rsamtools,rtracklayer,VGAM,qvalue
进口	方法,GenomeInfoDb,IRanges,Biostrings,data.table,sqldf,RColorBrewer
链接
建议	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked,BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5.masked
SystemRequirements
增强了
URL	http://r3cseq.genereg.net
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	r3Cseq_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	r3Cseq_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	r3Cseq_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/r3Cseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/r3Cseq/
包下载报告	下载数据