quantro

DOI:10.18129 / B9.bioc.quantro

何时使用分位数归一化的测试

Bioconductor版本:Release (3.6)

使用原始数据(例如继承eset的对象)对分位数规范化假设进行数据驱动测试(例如ExpressionSet, MethylSet)。还必须提供关于每个样本的组级信息(例如肿瘤/正常状态),因为测试评估用户定义的组之间的分布是否存在全局差异。

作者:斯蒂芬妮·希克斯和拉斐尔·伊瑞扎里

维护:Stephanie Hicks

引文(从R内,输入引用(“quantro”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“quantro”)

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PDF R脚本 quantro用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列MultipleComparison归一化预处理测序软件
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(3.5年)
许可证 GPL (> = 3)
取决于 R (>= 3.1.3)
进口 BiobaseminfidoParallelforeach迭代器ggplot2、方法、RColorBrewer
链接
建议 knitrRUnitBiocGenericsBiocStyle
SystemRequirements
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源包 quantro_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 quantro_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) quantro_1.12.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/quantro
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/quantro/
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