qpgraph

DOI:10.18129 / B9.bioc.qpgraph

估计的遗传和分子从高通量基因组学数据监管网络

Bioconductor版本:版本(3.6)

估计从高通量基因和eQTL网络表达和基因分型检测。

作者:罗伯特Castelo (aut (cre),阿尔贝托Roverato (aut)

维护人员:罗伯特Castelo <罗伯特。在upf.edu castelo >

从内部引用(R,回车引用(“qpgraph”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“qpgraph”)

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PDF BasicUsersGuide.pdf
PDF R脚本 估计使用qpgraph eQTL网络
PDF R脚本 逆向工程使用qpgraph转录调控网络
PDF R脚本 使用qpgraph模拟分子调控网络
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression,GeneRegulation,GeneticVariability,遗传学,GraphAndNetwork,微阵列,NetworkInference,通路,单核苷酸多态性,软件,转录
版本 2.12.0
Bioconductor自 BioC 2.4 (r - 2.9)(9年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 3.4)
进口 方法、并行矩阵(> = 1.0)、网格注释,(> = 1.45.1),Biobase,S4Vectors,BiocParallel,AnnotationDbi,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,GenomicFeatures,mvtnorm,qtl,Rgraphviz
链接
建议 RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,genefilter,org.EcK12.eg.db,rlecuyer,,类别,GOstats
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/rcastelo/qpgraph
BugReports https://github.com/rcastelo/rcastelo/issues
取决于我
进口我 限幅器,ToPASeq
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 qpgraph_2.12.0.tar.gz
Windows二进制 qpgraph_2.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) qpgraph_2.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qpgraph
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/qpgraph/
包下载报告 下载数据

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  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网