proteoQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.proteoQC

蛋白质组学数据质量控制的R包

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个包为基于MS/MS的蛋白质组学数据创建HTML格式的QC报告。该报告旨在让用户快速评估蛋白质组学数据的质量。

作者:博文， Laurent Gatto

维护者:博文<文博在genome .cn>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“proteoQC”)

文档

超文本标记语言	R脚本	00 proteoQC简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	MassSpectrometry，蛋白质组学，质量控制，ReportWriting，软件，可视化
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(3.5年)
许可证	LGPL-2
取决于	R (>= 3.0.0)，XML，维恩图，MSnbase
进口	rTANDEM，plyr，seqinr，喷嘴。R1，ggplot2，reshape2平行,rpx，tidyr，dplyr，情节，rmarkdown
链接
建议	RforProteomics，knitr，BiocStyle，R.utils，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/wenbostar/proteoQC
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	proteoQC_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	proteoQC_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	proteoQC_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proteoQC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/proteoQC/
软件包下载报告	下载数据