后代
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DOI:10.18129 / B9.bioc.progeny
从基因表达推断活性的通路响应基因
Bioconductor版本:Release (3.6)
这个包提供了一个使用PROGENy从基因表达推断途径活性的功能。它包含我们在“扰动响应基因揭示癌症基因表达中的信号足迹”出版物中推断的线性模型。
作者:Michael Schubert
维护者:Michael Schubert
引文(从R内，输入引用(“后代”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“后代”)
文档
| 超文本标记语言 | R脚本 | 用法示例 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | FunctionalPrediction，GeneExpression，GeneRegulation，软件，SystemsBiology |
| 版本 | 1.0.0 |
| 许可证 | Apache License (== 2.0) | file License |
| 取决于 | R (>= 3.4.0) |
| 进口 | Biobase |
| 链接 | |
| 建议 | 气道，biomaRt，BiocFileCache，扫帚，DESeq2，dplyr，knitr，readr，readxl |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/saezlab/progeny |
| BugReports | https://github.com/saezlab/progeny/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | progeny_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | progeny_1.0.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | progeny_1.0.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/progeny |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/progeny/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
