生物导体版本:版本(3.6)
PREBS软件包旨在使RNA-Service(RNA-SEQ)数据与微阵列数据更具可比性。可比性是通过使用RMA算法的修改版本来汇总探针区域测序表达式实现的。管道将映射的读取为输入,并产生基因表达式或原始微阵列探针集作为输出。
作者:Karolis Uziela和Antti Honkela
维护者:karolis uziela
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R脚本 | PreBS用户指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因表达,,,,微阵列,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.14.0),基因组签名,,,,副词,,,,RPA |
进口 | 平行,方法,统计,基因组机(> = 1.13.3),iranges,,,,生物酶,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS |
链接 | |
建议 | prebsdata,,,,HGU133PLUS2CDF,,,,HGU133PLUS2Probe |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | prebs_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | prebs_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | prebs_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/prebs |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/prebs/ |
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