Prebs

doi:10.18129/b9.bioc.prebs

RNA-seq数据的探针区域表达估计提高了微阵列可比性

生物导体版本:版本(3.6)

PREBS软件包旨在使RNA-Service(RNA-SEQ)数据与微阵列数据更具可比性。可比性是通过使用RMA算法的修改版本来汇总探针区域测序表达式实现的。管道将映射的读取为输入,并产生基因表达式或原始微阵列探针集作为输出。

作者:Karolis Uziela和Antti Honkela

维护者:karolis uziela

引用(从r内,输入引用(“ prebs”)):

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PDF R脚本 PreBS用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,微阵列,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.14.0),基因组签名,,,,副词,,,,RPA
进口 平行,方法,统计,基因组机(> = 1.13.3),iranges,,,,生物酶,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS
链接
建议 prebsdata,,,,HGU133PLUS2CDF,,,,HGU133PLUS2Probe
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取决于我
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建议我
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源包 prebs_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 prebs_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) prebs_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/prebs
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/prebs/
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