philr

DOI:10.18129 / B9.bioc.philr

基于系统分区的劳工关系转换为宏基因组数据

Bioconductor版本:版本(3.6)

PhILR是系统发育等距Log-Ratio变换。这个包提供了功能成分的分析数据(例如,数据代表的比例不同的变量/部分)。特别是这个包允许成分分析数据可以通过一个系统发育树相关的部分(如微生物群是常见的调查数据)并使之可用等距日志比例变换从系统发育树构建和利用加权参考措施。

作者:贾斯汀·西尔弗曼

维护人员:贾斯汀Silverman < jsilve24 gmail.com >

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文档

HTML	R脚本	介绍PhILR
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文本		新闻

细节

biocViews	宏基因组,微生物组,测序,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	猿,phangorn,tidyr,ggplot2,ggtree
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,phyloseq,glmnet,dplyr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jsilve24/philr
BugReports	https://github.com/jsilve24/philr/issues
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	philr_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	philr_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	philr_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/philr
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/philr/
包下载报告	下载数据