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pRoloc
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DOI:10.18129 / B9.bioc.pRoloc
一个统一的空间蛋白质组学的生物信息学框架
Bioconductor版本:版本(3.6)
pRoloc包实现了机器学习和可视化方法的分析和interogation quantitiative质谱数据可靠推断蛋白质亚细胞定位。
作者:Laurent和m . Breckels与和丽莎来自托马斯汉堡和塞缪尔Wieczorek
维修工:Laurent与< lg390在cam.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“pRoloc”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“pRoloc”)
文档
| HTML | R脚本 | 空间蛋白质组学的迁移学习算法 |
| HTML | R脚本 | 注释空间蛋白质组学数据 |
| HTML | R脚本 | 机器学习技术在pRoloc可用 |
| HTML | R脚本 | 使用pRoloc空间蛋白质组学数据分析 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 视频 | pRoloc, pRolocdata pRolocGUI |
细节
| biocViews | 分类,聚类,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,软件 |
| 版本 | 1.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 2.15),MSnbase(> = 1.19.20),MLInterfaces(> = 1.37.1)、方法Rcpp(> = 0.10.3),BiocParallel |
| 进口 | Biobase,mclust(> = 4.3),脱字符号,e1071,抽样,类,kernlab,Rtsne(> = 0.13),晶格,nnet,randomForest,代理,模糊神经网络,hexbin,BiocGenerics统计数据,dendextend,RColorBrewer,尺度,质量,knitr,mvtnorm,gtools,plyr,ggplot2,biomaRt跑龙套,grDevices图形 |
| 链接 | Rcpp,RcppArmadillo |
| 建议 | testthat,rmarkdown,pRolocdata(> = 1.9.4),roxygen2,synapter,xtable,rgl,BiocStyle(> = 2.5.19),hpar(> = 1.15.3),dplyr,GO.db,AnnotationDbi |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/lgatto/pRoloc |
| BugReports | https://github.com/lgatto/pRoloc/issues |
| 取决于我 | pRolocGUI |
| 进口我 | |
| 建议我 | MSnbase,pRolocdata,RforProteomics |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | pRoloc_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | pRoloc_1.18.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | pRoloc_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pRoloc |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pRoloc/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
