oppar

DOI:10.18129 / B9.bioc.oppar

R

Bioconductor版本:Release (3.6)

Wang et al.(2012)发布的mCOPA包的R实现。Oppar提供了癌症异常值分析方法。虽然最初是为了检测癌症研究中的异常基因而开发的，但oppar中提出的方法一般可用于异常谱分析。此外，还为基因集富集和通路分析提供了工具。

作者:王宸玮[aut]， Alperen Taciroglu [aut]， Stefan R Maetschke [aut]， Colleen C Nelson [aut]， Mark Ragan [aut]， Melissa Davis [aut]， Soroor Hediyeh zadeh [cre]， Momeneh Foroutan [ctr]

维护者:Soroor Hediyeh zadeh

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“oppar”)

文档

超文本标记语言	R脚本	OPPAR: R的离群值分布和通路分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneSetEnrichment，通路，软件，SystemsBiology
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.3)
进口	Biobase、方法、GSEABase，GSVA
链接
建议	knitr，rmarkdown，limma，org.Hs.eg.db，GO.db，雪、并行
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	oppar_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	oppar_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	oppar_1.6.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oppar
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/oppar/
软件包下载报告	下载数据