Bioconductor版本:版本(3.6)
这个包将芯片表达数据转换为降低了维数的元数据。它提供了各种sample-centered和团体可视化,样本相似性分析和功能富集分析。底层的SOM聚类算法结合特性,多维标度和降维,以及强大的可视化功能。它使固有的功能表达模块提取和描述数据。
作者:亨利Loeffler-Wirth izbi.uni-leipzig.de > < wirth和马丁Kalcher < mkalcher porkbox.net >
维护人员:亨利Loeffler-Wirth < wirth在izbi.uni-leipzig.de >
从内部引用(R,回车引用(“oposSOM”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“oposSOM”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“oposSOM”)
R脚本 | oposSOM用户指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataRepresentation,DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,软件,可视化 |
版本 | 1.16.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(3.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 3.0),igraph(> = 1.0.0) |
进口 | 耶鲁大学管理学院,fastICA,tsne,scatterplot3d,象图,fdrtool,猿,biomaRt,Biobase,arules |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://som.izbi.uni-leipzig.de |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | oposSOM_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | oposSOM_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | oposSOM_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oposSOM |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/oposSOM/ |
包下载报告 | 下载数据 |