netbenchmark

DOI:10.18129 / B9.bioc.netbenchmark

几种基因网络推理方法的基准测试

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个包从基因表达数据中实现了几个基因网络推理算法的基准测试。

作者:Pau Bellot, Catharina Olsen, Patrick Meyer，由Alexandre Irrthum贡献

维护者:Pau Bellot < Pau。Bellot在upc.edu>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“netbenchmark”)

文档

超文本标记语言	R脚本	Netbenchmark
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GraphAndNetwork，微阵列，网络，NetworkInference，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(3年)
许可证	Cc by-nc-sa 4.0
取决于	grndata(> = 0.99.3)
进口	Rcpp(> = 0.11.0)它,minet，randomForest，c3net，PCIT，GeneNet、工具、pracma，矩阵，corpcor，fdrtool
链接	Rcpp
建议	RUnit，BiocGenerics，knitr，图
SystemRequirements
增强了
URL	https://imatge.upc.edu/netbenchmark/
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	netbenchmark_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	netbenchmark_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	netbenchmark_1.10.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/netbenchmark
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/netbenchmark/
软件包下载报告	下载数据