MVGST

doi：10.18129/b9.bioc.mvgst

多变量和定向基因集测试

生物导体版本：版本（3.6）

MVGST提供了独立于平台的工具来识别在多个感兴趣的对比度上具有差异性活跃（上或向下）的GO术语（基因集）。给定一个单方面p值的矩阵（基因的行，对比的列），MVGST使用荟萃分析方法将所有注释到每个基因集的基因组合在一起，然后将每个基因设置为更明显地为更大的基因。在每个感兴趣的对比度中，活性（1），较小的（-1）或没有显着差异的活性（0）。有了多个感兴趣的对比，每个基因集都被分配给差异活性的轮廓（跨对比度）。还提供了用于可视化（在GO图中）的工具，该基因集分类为给定配置文件。

作者：John R. Stevens和Dennis S. Mecham

维护者：约翰·史蒂文斯（John R. Stevens）

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PDF	R脚本	MVGST教程小插图
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细节

生物浏览	差异性，，，，去，，，，基因烯，，，，GraphandNetwork，，，，微阵列，，，，Onechannel，，，，途径，，，，rnaseq，，，，软件
版本	1.12.2
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（3.5岁）
执照	GPL-3
要看	r（> = 2.10.0），go.db，，，，rgraphviz
进口	Gprofiler，，，，Stringr，，，，topgo，，，，gostats，，，，注释，，，，AnnotationDbi，，，，图形
链接
建议	hgu133plus2.db，，，，org.hs.eg.db
系统要求
增强
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取决于我
进口我
建议我
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包装档案

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源包	mvgst_1.12.2.2.tar.gz
Windows二进制	mvgst_1.12.2.2.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	mvgst_1.12.2.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mvgst
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/mvgst/
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