马赛克

DOI:10.18129 / B9.bioc.mosaics

此包适用于Bioconductor 3.6版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见jmosaic．

mosaic(基于模型的ChIP-Seq单样本和双样本分析和推断)

Bioconductor版本:Release (3.6)

该软件包提供了MOSAiCS和MOSAiCS- hmm的拟合功能，MOSAiCS- hmm是一个统计框架，用于分析转录因子结合和组蛋白修饰的单样本或双样本ChIP-seq数据。

作者:钟东军，宽培芬，Rene Welch, Sunduz Keles

维护者:Dongjun Chung < Dongjun。钟在gmail.com>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“马赛克”)

文档

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PDF	R脚本	马赛克
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学，ChIPseq，遗传学，测序，软件，转录
版本	2.16.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(7年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 3.0.0)，方法，图形，Rcpp
进口	质量样条函数,晶格，IRanges，GenomicRanges，GenomicAlignments，Rsamtools，GenomeInfoDb，S4Vectors
链接	Rcpp
建议	mosaicsExample
SystemRequirements	Perl
增强了	平行
URL	http://groups.google.com/group/mosaics_user_group
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	mosaics_2.16.0.tar.gz
Windows二进制	mosaics_2.16.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	mosaics_2.16.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaics
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mosaics/
软件包下载报告	下载数据