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methyvim
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DOI:10.18129 / B9.bioc.methyvim
基于可变重要性度量的目标最小损失估计的差异甲基化分析
Bioconductor版本:Release (3.6)
该软件包提供了基于可变重要性度量(VIMs)的差异甲基化分析工具，VIMs是因果推断中出现的一类统计目标参数。所提供的估计和推断程序是非参数的，依靠集成机器学习来灵活地评估协变量和感兴趣的结果之间的函数关系。这些工具可以应用于CpG位点水平的差异甲基化，并在多次假设检验后进行有效推断。
作者:Nima Hejazi [aut, cre, cph]， Rachael Phillips [ctb]， Alan Hubbard [ctb]， Mark van der Laan [aut]
维护者:Nima Hejazi
引文(从R内，输入引用(“methyvim”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“methyvim”)
文档
| 超文本标记语言 | R脚本 | 甲基化:DNA甲基化的可变重要性 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 聚类，DNAMethylation，DifferentialMethylation，MethylSeq，MethylationArray，软件 |
| 版本 | 1.0.0 |
| 许可证 | 文件许可 |
| 取决于 | R (>= 3.4.0) |
| 进口 | 统计数据,集群、方法、ggplot2，gridExtra，过热，wesanderson，magrittr，dplyr，gtools，tmle，未来，doFuture，BiocParallel，BiocGenerics，SummarizedExperiment，GenomeInfoDb，bumphunter，IRanges，limma，minfi |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，SuperLearner，地球，nnet，gam，手臂，雪平行,BatchJobs，minfiData，methyvimData |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/nhejazi/methyvim |
| BugReports | https://github.com/nhejazi/methyvim/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | methyvim_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | methyvim_1.0.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | methyvim_1.0.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methyvim |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/methyvim/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
