methylInheritance

DOI:10.18129 / B9.bioc.methylInheritance

基于置换的分析,将一代到下一代的保守差异甲基化元素与治疗效果联系起来

Bioconductor版本:Release (3.6)

基于蒙特卡罗抽样的排列分析,用于检验以下假设:几代之间保守的差异甲基化元素的数量与从处理中继承的效应有关,并且可以忽略随机效应。

作者:Astrid Deschênes, Pascal Belleau和Arnaud Droit

维护者:Astrid Deschenes

引文(从R内,输入引用(“methylInheritance”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“methyllinheritance”)

文档

超文本标记语言 R脚本 基于置换的分析,将一代到下一代的保守差异甲基化元素与治疗效果联系起来
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BiologicalQuestionDNAMethylationDifferentialMethylation表观遗传学MethylSeq测序软件StatisticalMethodWholeGenome
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(1年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.4)
进口 methylKitBiocParallelGenomicRangesIRangesS4Vectors,方法,并行,ggplot2gridExtra字谜
链接
建议 BiocStyleBiocGenericsknitrrmarkdownRUnitmethInheritSim
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/adeschen/methylInheritance
BugReports https://github.com/adeschen/methylInheritance/issues
全靠我
进口我
建议我 methInheritSim
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 methylInheritance_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 methylInheritance_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) methylInheritance_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylInheritance
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/methylInheritance/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网