甲基分析

doi:10.18129/b9.bioc.Methyanalysis

DNA甲基化数据分析和可视化

生物导体版本:版本(3.6)

甲基分析套件旨在进行DNA甲基化数据分析和可视化。定义了Methygenoset类,以将染色体位置信息与数据保持一致。该软件包还包括估计Methy-Seq数据中甲基化水平的功能。

作者:Pan Du,Richard Bourgon

维护者:pan du ,lei huang ,gang feng feng

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PDF R脚本 甲基分析套件的介绍
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文本 消息

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,微阵列,,,,软件,,,,可视化
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(5。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.10),网格,生物基因,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,生物酶(> = 2.34.0),org.hs.eg.db
进口 grdevices,统计,utils,Lumi,,,,甲基菌,,,,GVIZ,,,,Genoset,,,,总结性特征,,,,iranges,,,,基因组机,,,,变体,,,,rtracklayer,,,,GenomicFeatures,,,,注释,,,,生物酶(> = 2.5.5),AnnotationDbi,,,,GeneFilter,,,,Biomart,方法,并行
链接
建议 FDB.Infinium -Methylation.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 甲基菌
构建报告

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源包 Methyanalysis_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 Methyanalysis_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Methyanalysis_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methyanalysis
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/methyanalysis/
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