metaseqR

DOI:10.18129 / B9.bioc.metaseqR

R包RNA-Seq数据的分析和结果报告通过结合多个统计算法。

Bioconductor版本:版本(3.6)

提供了一个接口几个正常化RNA-Seq基因表达数据和统计测试包。此外,它创造了几次诊断阴谋,执行combinining荟萃分析的几个统计测试的结果和报告结果以互动的方式。

作者:Panagiotis Moulos < Moulos在fleming.gr >

维护人员:Panagiotis Moulos < Moulos在fleming.gr >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“metaseqR”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“metaseqR”)

PDF	R脚本	RNA-Seq数据分析使用与metaseqR mulitple统计算法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,归一化,预处理,质量控制,RNASeq,ReportWriting,软件,WorkflowStep
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(4年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 2.13.0),EDASeq,DESeq,limma,qvalue
进口	刨边机,NOISeq,baySeq,NBPSeq,biomaRt跑龙套,gplots,corrplot,vsn,酿造,rjson,log4r
链接
建议	BiocGenerics,GenomicRanges,rtracklayer,Rsamtools,survcomp,维恩图,knitr,动物园,RUnit,BiocInstaller,BSgenome,RSQLite
SystemRequirements
增强了	平行,移行细胞癌,RMySQL
URL	http://www.fleming.gr
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	metaseqR_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	metaseqR_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	metaseqR_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metaseqR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/metaseqR/
包下载报告	下载数据