莱斯

DOI:10.18129 / B9.bioc.les

识别平铺微阵列数据中的差异效应

Bioconductor版本:Release (3.6)

“les”包估计平铺微阵列数据中的增强显著性位点(les)。这些是调控区域,如在差异转录、CHiP-chip或DNA修饰分析中发现的。该软件包提供了一个通用框架,适用于识别平铺微阵列数据集中的差异效应,并且独立于单个探针级别的底层统计数据。

作者:Julian Gehring, Clemens Kreutz, Jens Timmer

维护者:Julian Gehring

引文(从R内,输入引用(les)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“les”)

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PDF R脚本 les包介绍:用增强显著性框架的位点识别平铺微阵列数据中的差异效应
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文本 许可证

细节

biocViews ChIPchipDNAMethylationDifferentialExpression微阵列软件转录
版本 1.28.0
在Bioconductor BioC 2.7 (R-2.12)(7.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 2.13.2),方法,图形,fdrtool
进口 引导gplotsRColorBrewer
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源包 les_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 les_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) les_1.28.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/les
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/les/
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