karyoploteR

DOI:10.18129 / B9.bioc.karyoploteR

绘制可定制的线性基因组，显示任意数据

Bioconductor版本:Release (3.6)

核型图创建任意基因组的核型图，并提供了一套完整的功能来绘制它们上的任意数据。它模仿许多R基图形函数，将它们与坐标变化函数耦合，自动将染色体和数据坐标映射到图形坐标中。除了提供的数据绘图功能外，还可以轻松添加新的功能。

作者:Bernat Gel

维护者:Bernat Gel

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“核ploter”)

文档

超文本标记语言	R脚本	karyoploteR装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，CopyNumberVariation，报道，DNASeq，DataImport，MethylSeq，OneChannel，测序，软件，可视化
版本	1.4.2
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4)，地区，GenomicRanges、方法
进口	地区，GenomicRanges，IRanges，Rsamtools，统计，图形，memoise，rtracklayer，GenomeInfoDb，S4Vectors，biovizBase，消化，贝塞尔曲线
链接
建议	BiocStyle，knitr，testthat，magrittr，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，pasillaBamSubset
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	karyoploteR_1.4.2.tar.gz
Windows二进制	karyoploteR_1.4.2.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	karyoploteR_1.4.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/karyoploteR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/karyoploteR/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档