joda

DOI:10.18129 / B9.bioc.joda

利用知识量化基因调控的JODA算法

Bioconductor版本:Release (3.6)

包“joda”实现了名为joda的算法的三个步骤。该算法计算基因放松管制得分。对于每个基因，其解除管制得分反映了在两个不同的细胞群中，某种调控因子对该基因的扰动的影响有多强烈。该算法利用了调节器击倒表达式数据以及有关调节器所涉及的信号通路的知识(在一个简单的矩阵模型中正式化)。

作者:Ewa Szczurek

维护者:Ewa Szczurek < Szczurek at molgen.mpg.de>

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browseVignettes(“joda”)

PDF	R脚本	joda简介
PDF		参考手册

细节

biocViews	GraphAndNetwork，微阵列，NetworkInference，通路，软件，StatisticalMethod
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(7年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.0)，bgmm，RBGL
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建议
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增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com
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包档案

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源包	joda_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	joda_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	joda_1.26.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/joda
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/joda/
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