isomiRs

DOI:10.18129 / B9.bioc.isomiRs

分析小型RNA-seq isomiRs和microrna

Bioconductor版本:版本(3.6)

描述的microrna isomiRs,集群和微分表达式。

作者:曾淡水沼泽(aut (cre),格鲁吉亚Escaramis (aut),克里斯托Argyropoulos (aut)

维护人员:曾淡水沼泽<罗瑞拉。淡水沼泽gmail.com >

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PDF	R脚本	isomiRs
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类,DifferentialExpression,RNASeq,软件,microrna的
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(2年)
许可证	麻省理工学院+文件许可
取决于	R (> = 3.4),DiscriMiner,SummarizedExperiment,三甲(> = 1.7.6),RcppEigen
进口	BiocGenerics(> = 0.7.5),IRanges,S4Vectors,GenomicRanges,Biobase,DESeq2,重塑,tidyr,readr,dplyr,RColorBrewer,gplots、方法、ggplot2,gtools,gridExtra、网格grDevices、图形数据,GGally,gamlss,lme4,gamlss.dist
链接	三甲,RcppEigen
建议	knitr,RUnit,org.Mm.eg.db,集群,clusterProfiler,pheatmap,BiocStyle,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	isomiRs_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	isomiRs_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	isomiRs_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isomiRs
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/isomiRs/
包下载报告	下载数据