等压线

DOI:10.18129 / B9.bioc.isobar

标记msm蛋白质组学数据分析和定量的恒压的

Bioconductor版本:版本(3.6)

等压线提供方法预处理、标准化和报告生成的定量质谱的蛋白质组学数据分析与等压标签标记,如iTRAQ和TMT。功能模块集成和验证PTM-centric数据集(isobar-PTM)。更多信息在http://www.ms-isobar.org上。

作者:Florian P布雷<弗洛里安。bw gmail.com >和Jacques Colinge , with contributions from Alexey Stukalov , Xavier Robin and Florent Gluck

维护人员:Florian P布雷<弗洛里安。bw gmail.com >

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文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学,MassSpectrometry,MultipleComparisons,蛋白质组学,质量控制,软件
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(6.5年)
许可证	LGPL-2
取决于	R (> = 2.10.0),Biobase、统计数据、方法
进口	分配,plyr,biomaRt,ggplot2
链接
建议	MSnbase,OrgMassSpecR,XML,RJSONIO,Hmisc,gplots,RColorBrewer,gridExtra,limma,引导,DBI,质量
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/fbreitwieser/isobar
BugReports	https://github.com/fbreitwieser/isobar/issues
取决于我
进口我
建议我	RforProteomics
构建报告

包档案

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源包	isobar_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	isobar_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	isobar_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isobar
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/isobar/
包下载报告	下载数据