iontree

DOI:10.18129 / B9.bioc.iontree

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此包适用于Bioconductor 3.6版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本,请参见iontree

离子阱质谱离子树的数据管理和分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

离子碎裂为代谢物鉴定提供了结构信息。该软件包提供实用功能来管理和分析来自离子阱质谱的MS2/MS3碎片数据。它是为收集了许多生物样本和大量离子树的高通量代谢组学数据而设计的。已经对低分辨率质谱数据进行了测试,但可以很容易地扩展到基于前体离子的高分辨率质谱碎片数据。

作者:曹明树

维护者:曹明淑<明淑。agresearch.co.nz>的曹

引文(从R内,输入引用(“iontree”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“iontree”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“iontree”)

PDF R脚本 MSn
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews MassSpectrometry代谢组学软件
版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(6.5年)
许可证 GPL-2
取决于 方法,rJavaRSQLiteXML
进口
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建议 iontreeData
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增强了
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包档案

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源包 iontree_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 iontree_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) iontree_1.24.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iontree
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/iontree/
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