illuminaio

DOI:10.18129 / B9.bioc.illuminaio

解析Illumina公司微阵列输出文件

Bioconductor版本:版本(3.6)

工具解析Illumina公司的微阵列输出文件,包括IDAT。

作者:凯斯·巴格利(aut),亨利克·本特松(aut) Kasper丹尼尔·汉森(aut (cre),马特·里奇(aut),迈克·l·史密斯(aut)蒂姆Triche Jr .)(施)

维修工:Kasper丹尼尔·汉森< kasperdanielhansen gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“illuminaio”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“illuminaio”)

文档

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browseVignettes (“illuminaio”)

PDF 加密IDAT格式的描述
PDF R脚本 介绍illuminaio
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,基础设施,微阵列,ProprietaryPlatforms,软件
版本 0.20.0
Bioconductor自 BioC 2.12 (r - 3.0)(5年)
许可证 GPL-2
取决于
进口 base64
链接
建议 RUnit,BiocGenerics,IlluminaDataTestFiles(> = 1.0.2中),BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/HenrikBengtsson/illuminaio
BugReports https://github.com/HenrikBengtsson/illuminaio/issues
取决于我 normalize450K,RnBeads,西瓜
进口我 beadarray,冠军,crlmm,methylumi,minfi
建议我 limma
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 illuminaio_0.20.0.tar.gz
Windows二进制 illuminaio_0.20.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) illuminaio_0.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/illuminaio
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/illuminaio/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网