htSeqTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.htSeqTools

质量控制、可视化和高通量测序数据的处理

Bioconductor版本:版本(3.6)

我们提供高效、易用的工具,用于高通量测序(ChIP-seq RNAseq等等)。这些包括MDS情节(PCA)类似物,检测效率低下immuno-precipitation或over-amplification工件,工具来识别和检测基因组,积累读取大的区域,和可视化的配置文件。

作者:Evarist星球,卡米尔Stephan-Otto,奥斯卡雷纳,奥斯卡弗洛雷斯,大卫Rossell

维护人员:奥斯卡雷纳<奥斯卡。雷纳在irbbarcelona.org >

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细节

biocViews	质量控制,测序,软件
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(6.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 2.12.2)、方法BiocGenerics(> = 0.1.0),Biobase,S4Vectors,IRanges、方法、质量,BSgenome,GenomeInfoDb(> = 1.1.3),GenomicRanges(> = 1.17.11)
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增强了	同时,多核
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包档案

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源包	htSeqTools_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	htSeqTools_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	htSeqTools_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/htSeqTools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/htSeqTools/
包下载报告	下载数据