石墨

DOI:10.18129 / B9.bioc.graphite

从路径拓扑图形交互环境

Bioconductor版本:版本(3.6)

图形对象从路径拓扑来源于Biocarta, HumanCyc, KEGG, NCI,豹,Reactome和峰值数据库。

作者:< Gabriele Gabriele销售。销售unipd.it >,Enrica Calura , Chiara Romualdi

维护人员:Gabriele销售< Gabriele。销售unipd.it >

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PDF	R脚本	从路径拓扑图形交互环境
HTML		metabolites.html
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BioCarta,GraphAndNetwork,KEGG,代谢组学,网络,通路,Reactome,软件,ThirdPartyClient
版本	1.24.1
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(6.5年)
许可证	AGPL-3
取决于	R(> = 2.10),方法
进口	AnnotationDbi,使彻底失败,图,httr,rappdirs统计,跑龙套
链接
建议	a4Preproc,所有,BiocStyle,限幅器,codetools,hgu133plus2.db,hgu95av2.db,嫁祸于,knitr,org.Hs.eg.db平行,R.rsp,RCy3,rmarkdown,SPIA(> = 2.2),testthat,topologyGSA(> = 1.4.0)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	ToPASeq
进口我	facopy,mogsa,ReactomePA
建议我	限幅器
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	graphite_1.24.1.tar.gz
Windows二进制	graphite_1.24.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	graphite_1.24.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/graphite
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/graphite/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.6源码包	源存档