goseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.goseq

基因本体论分析器RNA-seq和其他长度偏差数据

Bioconductor版本:版本(3.6)

检测基因本体和/或其他用户定义的类别/ /在RNA-seq表示数据

作者:马修年轻

维护人员:Nadia戴维森<纳迪亚。戴维森在mcri.edu.au >,安东尼·霍金斯<安东尼。霍金斯在mcri.edu.au >

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PDF	R脚本	goseq用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	去,GeneExpression,RNASeq,测序,软件,转录
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(8年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.11.0),BiasedUrn,geneLenDataBase(> = 1.9.2)
进口	mgcv、图表、数据、跑龙套,AnnotationDbi,GO.db,BiocGenerics
链接
建议	刨边机,org.Hs.eg.db,rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	rgsepd
进口我	冠军,理想的,PathwaySplice,击杀
建议我	oneChannelGUI
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	goseq_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	goseq_1.30.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	goseq_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/goseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/goseq/
包下载报告	下载数据