gespeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.gespeR

基因特异性表型估计器

Bioconductor版本:Release (3.6)

从脱靶混杂RNAi筛选估计基因特异性表型。每个siRNA的表型是基于靶向和非靶向基因，使用正则化线性回归模型建模。

作者:Fabian sch密西根

维护者:Fabian sch密西根< Fabian。sch密西根在bsse.ethz.ch>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gespeR”)

文档

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PDF	R脚本	一个用于反卷积脱靶混淆RNAi屏幕的R包
PDF		参考手册

细节

biocViews	CellBasedAssays，GeneTarget，预处理，回归，软件，可视化
版本	1.10.1
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	方法、图形ggplot2， r (>= 2.10)
进口	矩阵，glmnet，cellHTS2，Biobase，biomaRt，doParallel平行,foreach，reshape2，dplyr
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cbg.ethz.ch/software/gespeR
全靠我
进口我	eiR
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	gespeR_1.10.1.tar.gz
Windows二进制	gespeR_1.10.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	gespeR_1.10.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gespeR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gespeR/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档