genefilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.genefilter

genefilter:筛选基因高通量实验的方法

Bioconductor版本:版本(3.6)

一些基本的功能筛选基因

作者:r .绅士,诉凯利,w·胡贝尔Hahne

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

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browseVignettes (“genefilter”)

PDF	R脚本	增加额外的情节:独立的过滤能力检测差异表达基因,Bourgon et al ., PNAS (2010)
PDF	R脚本	诊断为独立的过滤
PDF	R脚本	如何找到类似于指定基因的表达谱的基因吗
PDF	R脚本	使用genefilter函数过滤基因微阵列数据集
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列,软件
版本	1.60.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 13年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	S4Vectors(> = 0.9.42),AnnotationDbi,注释,Biobase、图形、方法、统计数据生存
链接
建议	类,hgu95av2.db,tkWidgets,所有,中华民国,DESeq,pasilla,BiocStyle,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	a4Base,ampliQueso,cellHTS2,魅力,CNTools,GeneMeta,Hiiragi2013,simpleaffy,SISPA,股东价值分析
进口我	affyQCReport,annmap,arrayQualityMetrics,类别,cbaf,covRNA,DESeq,DESeq2,DEXSeq,eisa,gCMAP,GGBase,GISPA,GSRI,IHWpaper,JunctionSeq,methyAnalysis,methylumi,minfi,MLInterfaces,mogsa,pcaExplorer,PECA,phenoTest,林格,RNAinteractMAPK,simpleaffy,TCGAbiolinks,tilingArray,XDE,zinbwave
建议我	AffyExpress,注释,ArrayTools,BiocCaseStudies,生命网络,categoryCompare,clusterStab,codelink,compcodeR,curatedBladderData,curatedCRCData,curatedOvarianData,DelayedArray,EnrichedHeatmap,factDesign,ffpe,ffpeExampleData,gageData,GenoGAM,GenomicFiles,GOstats,GSAR,GSEAlm,GSVA,logicFS,光民,MAQCsubset,MCRestimate,npGSEA,益生元,oneChannelGUI,phyloseq,pvac,qpgraph,RforProteomics,rheumaticConditionWOLLBOLD,rtracklayer,siggenes,Single.mTEC.Transcriptomes,SSPA,topGO
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	genefilter_1.60.0.tar.gz
Windows二进制	genefilter_1.60.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	genefilter_1.60.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefilter
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/
包下载报告	下载数据