funtooNorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.funtooNorm

标准化程序英飞纳姆HumanMethylation450 BeadChip工具包

Bioconductor版本:版本(3.6)

提供了一个功能正常化Illumina公司英人类甲基化450 BeadChip (Illumina公司450 k),纠正组织和/或细胞类型。

作者:西莉亚Greenwood <西莉亚。格林伍德在麦吉尔。ca >,斯捷潘Grinek <斯捷潘。grinek ladydavis。ca >,马克西姆鲟鳇鱼<马克西姆。在mail.mcgill鲟鳇鱼。ca >,凯瑟琳·克莱因<凯萨琳。克莱恩在mail.mcgill.ca >

维修工:凯萨琳克莱因<凯萨琳。克莱恩在mail.mcgill.ca >

从内部引用(R,回车引用(“funtooNorm”)):

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“funtooNorm”)

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PDF R脚本 正常化Illumina公司英人类甲基化450 k与funtooNorm多种细胞类型
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文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylation,归一化,预处理,软件
版本 1.2.0
Bioconductor自 BioC 3.5 (r - 3.4)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.4)
进口 ,matrixStats,minfi、方法、IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,GenomeInfoDbgrDevices图形,统计数据
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建议 prettydoc,minfiData,knitr,rmarkdown
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源包 funtooNorm_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 funtooNorm_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) funtooNorm_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/funtooNorm
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/funtooNorm/
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