面部

doi：10.18129/b9.bioc

基于特征的关联和基因 - 基因富集用于癌症的拷贝数改变分析

生物导体版本：版本（3.6）

Facopy是用于微调癌症CNA关联建模的R包装。关联直接以感兴趣的基因组特征进行测量，并且对于基因而言，由于数据的新内部处理，可以进行下游基因富集分析。该软件开辟了一种方法，可以系统地仔细检查跨肿瘤表型的CNA分布的差异，例如与肿瘤类型，位置和进展相关的CNA分布。当前，支持了11种不同方法的输出格式，这些方法分析了全基因组/外显子组测序和SNP微阵列的数据。还支持多种基因组，改变类型和变量类型。

作者：David Mosen-Ansorena

维护者：David Mosen-Ansorena

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PDF	R脚本	面部
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细节

生物浏览	库务，，，，基因烯，，，，遗传学，，，，基因组变量，，，，微阵列，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.12.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（3.5岁）
执照	CC BY-NC 4.0
要看	r（> = 3.0），方法，CGDSR（> = 1.1.30），硬币（> = 1.0），GGPLOT2，，，，栅格，，，，facopy.annot， 网格
进口	注释，，，，Data.Table，，，，剂量，，，，Factominer，，，，go.db，，，，gostats，，，，石墨，，，，Igraph，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，大量的，，，，nnet，，，，RESHAPE2，，，，rgraphviz，，，，秤
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源包	Facopy_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	Facopy_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	Facopy_1.12.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/facopy
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/facopy/
软件包下载报告	下载统计