生物导体版本:版本(3.6)
通过CHIP-SEQ获得的基于RNA-SEQ或微阵列基因转录和组蛋白修饰数据的集成分析的包装。该软件包提供了用于数据预处理和匹配的方法以及适合贝叶斯混合模型的方法,以检测两种数据类型差异的基因。
作者:汉斯·乌尔里希·克莱因(Hans-Ulrich Klein),马丁·谢弗(Martin Schaefer)
维护者:hans-ulrich klein
引用(从r内,输入引用(“ Epegenomix”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ epigenomix”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Epegenomix”)
R脚本 | Epigenomix软件包小插图 | |
参考手册 |
生物浏览 | chipseq,,,,分类,,,,差异性,,,,基因表达,,,,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(5年) |
执照 | LGPL-3 |
要看 | r(> = 3.2.0),方法,生物酶,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机,,,,总结性特征 |
进口 | 生物基因,,,,MCMCPACK,,,,rsamtools, 平行,GenomeInfodB,,,,Beadarray |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | epigenomix_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | epigenomix_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Epigenomix_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epigenomix |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/epigenomix/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |