Epgenomix

doi:10.18129/b9.bioc.pepigenomix

表观遗传和基因转录数据归一化以及与混合模型的整合

生物导体版本:版本(3.6)

通过CHIP-SEQ获得的基于RNA-SEQ或微阵列基因转录和组蛋白修饰数据的集成分析的包装。该软件包提供了用于数据预处理和匹配的方法以及适合贝叶斯混合模型的方法,以检测两种数据类型差异的基因。

作者:汉斯·乌尔里希·克莱因(Hans-Ulrich Klein),马丁·谢弗(Martin Schaefer)

维护者:hans-ulrich klein

引用(从r内,输入引用(“ Epegenomix”)):

安装

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PDF R脚本 Epigenomix软件包小插图
PDF 参考手册

细节

生物浏览 chipseq,,,,分类,,,,差异性,,,,基因表达,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(5年)
执照 LGPL-3
要看 r(> = 3.2.0),方法,生物酶,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机,,,,总结性特征
进口 生物基因,,,,MCMCPACK,,,,rsamtools, 平行,GenomeInfodB,,,,Beadarray
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源包 epigenomix_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 epigenomix_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Epigenomix_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epigenomix
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/epigenomix/
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