epiNEM

DOI:10.18129 / B9.bioc.epiNEM

epiNEM

Bioconductor版本:Release (3.6)

epiNEM是原始嵌套效应模型(NEM)的扩展。EpiNEM能够考虑双重敲除,并推断出更复杂的网络信号通路。

作者:Madeline Diekmann & Martin Pirkl

维护者:Martin Pirkl < Martin。Pirkl在bsse.ethz.ch>

引文(从R内,输入引用(“epiNEM”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“epiNEM”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“epiNEM”)

PDF R脚本 epiNEM
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 网络NetworkInference通路软件SystemsBiology
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.4)
进口 BoolNete1071gtools统计数据,igraphnem跑龙套,晶格latticeExtraRColorBrewerpcalgminetgrDevices,
链接
建议 knitrRUnitBiocGenericsSTRINGdbdevtoolsrmarkdownGOSemSimAnnotationHuborg.Sc.sgd.db
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增强了
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包档案

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源包 epiNEM_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 epiNEM_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) epiNEM_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epiNEM
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/epiNEM/
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