Bioconductor版本:Release (3.6)
epiNEM是原始嵌套效应模型(NEM)的扩展。EpiNEM能够考虑双重敲除,并推断出更复杂的网络信号通路。
作者:Madeline Diekmann & Martin Pirkl
维护者:Martin Pirkl < Martin。Pirkl在bsse.ethz.ch>
引文(从R内,输入引用(“epiNEM”)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“epiNEM”)
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browseVignettes(“epiNEM”)
R脚本 | epiNEM | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 网络,NetworkInference,通路,软件,SystemsBiology |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(1年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.4) |
进口 | BoolNet,e1071,gtools统计数据,igraph,nem跑龙套,晶格,latticeExtra,RColorBrewer,pcalg,minetgrDevices,图 |
链接 | |
建议 | knitr,RUnit,BiocGenerics,STRINGdb,devtools,rmarkdown,GOSemSim,AnnotationHub,org.Sc.sgd.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | epiNEM_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | epiNEM_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | epiNEM_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epiNEM |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/epiNEM/ |
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