EDGER

doi：10.18129/b9.bioc.edger

R中数字基因表达数据的经验分析

生物导体版本：版本（3.6）

带有生物复制的RNA-SEQ表达谱的差异表达分析。基于负二项式分布，包括经验贝叶斯估计，精确测试，广义线性模型和准类似测试，实现了一系列统计方法。除RNA-Seq外，它还适用于其他类型的基因组数据的差异信号分析，这些数据产生计数，包括Chip-Seq，Bisulfite-Seq，Sage和Cage。

作者：yunshun chen ，aaron lun ，davis McCarthy ，xiaobei zhou zhou ，gordon smyth

维护者：yunshun chen ，aaron lun ，马克·罗宾逊（Mark Robinson>，gordon smyth

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细节

生物浏览	替代方案，，，，批处理效应，，，，贝叶斯，，，，chipseq，，，，聚类，，，，覆盖范围，，，，DNAMETHYLATY，，，，差异性，，，，差甲基化，，，，差速器，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，遗传学，，，，多重组合，，，，正常化，，，，途径，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，回归，，，，智者，，，，测序，，，，软件，，，，时间科，，，，转录
版本	3.20.9
在生物导体中	Bioc 2.3（R-2.8）（9。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 2.15.0），林玛（> = 3.34.5）
进口	图形，统计，utils，方法，Locfit，，，，RCPP
链接	RCPP
建议	AnnotationDbi，，，，org.hs.eg.db，花键
系统要求	C ++ 11
增强
URL	http://bioinf.wehi.edu.au/edger
取决于我	阿斯普利，，，，dbchip，，，，埃达，，，，兴趣，，，，蝠ta，，，，甲基mn，，，，mlseq，，，，rnaseqgeneedgerql，，，，rnaseqsamplesizedata，，，，Ruvseq，，，，samexplorer，，，，TCC，，，，翻译
进口我	Affycoretools，，，，ampliqueso，，，，anota2seq，，，，arrayexpresshts，，，，贝塞克，，，，compcoder，，，，Coseq，，，，CSAW，，，，碎片器，，，，变形，，，，DegReport，，，，Desubs，，，，差异，，，，Diffhic，，，，diffloop，，，，Drimseq，，，，EasyRnaseq，，，，EBSEA，，，，埃达，，，，EEGC，，，，Egsea，，，，富集兄弟，，，，Erccdashboard，，，，glimma，，，，htsfilter，，，，同工型间分析仪，，，，Medips，，，，metaseqr，，，，Migsa，，，，MSGBSR，，，，msmstests，，，，Pathostat，，，，恰当的，，，，psichomics，，，，属属，，，，regsplice，，，，repitools，，，，报告工具，，，，RNASEQMAP，，，，rnaseqsamples，，，，评分，，，，SCDE，，，，烤饼，，，，斯克兰，，，，飞溅，，，，stategra，，，，SVAPLSSEQ，，，，Systempiper，，，，tcgabiolinks，，，，TCSEQ，，，，topaseq，，，，Tweedeseq，，，，纱，，，，Zinbwave
建议我	absseq，，，，生物室，，，，bitseq，，，，分类，，，，克洛诺特犬，，，，CQN，，，，Cydar，，，，EDASEQ，，，，量规，，，，gcrisprtools，，，，基因组签名，，，，基因组机，，，，Goseq，，，，grohmm，，，，GSAR，，，，GSVA，，，，理想的，，，，JCTSEQDATA，，，，Leebamviews，，，，甲基小姐，，，，多米，，，，Onechannelgui，，，，地区报告，，，，SSPA，，，，斯塔格，，，，subseq，，，，tximport，，，，方差分区，，，，ZFPKM
构建报告

包装档案

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源包	edger_3.20.9.9.tar.gz
Windows二进制	edger_3.20.9.9.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.11（El Capitan）	edger_3.20.9.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/edger
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/edger/
软件包下载报告	下载统计
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