doppelgangR

DOI:10.18129 / B9.bioc.doppelgangR

识别可能重复样本基因或元数据

Bioconductor版本:版本(3.6)

主要功能是doppelgangR(),它需要作为最小输入ExpressionSet对象的列表,列表和搜索所有对复制样品。搜索是基于基因组数据(exprs (eset)),表现型/临床数据(pData (eset)),和“吸烟枪”——据说pData中发现的惟一标识符(eset)。

作者:利Waldron马库斯·里斯马塞尔·拉莫斯

维护人员:利未Waldron < lwaldron。研究在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“doppelgangR”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“doppelgangR”)

文档

HTML R脚本 doppelgangR装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression,微阵列,质量控制,RNASeq,软件
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 3.3 (r - 3.3)(2年)
许可证 GPL (> = 2.0)
取决于 R (> = 3.3),Biobase,BiocParallel
进口 股东价值分析,嫁祸于,消化,mnormt、方法、grDevices图形、统计、跑龙套
链接
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown,curatedOvarianData,ROCR,pROC,RUnit,simulatorZ,代理
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/lwaldron/doppelgangR
BugReports https://github.com/lwaldron/doppelgangR/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 doppelgangR_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 doppelgangR_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) doppelgangR_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/doppelgangR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/doppelgangR/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网