diffloop

DOI:10.18129 / B9.bioc.diffloop

从染色质拓扑数据识别差异DNA环

Bioconductor版本:Release (3.6)

一套用于子集、可视化、注释和统计分析一个或多个ChIA-PET实验或其他推断染色质环的分析结果的工具。

作者:Caleb Lareau [aut, cre], Martin Aryee [aut]

维护者:Caleb Lareau

引文(从R内,输入引用(“diffloop”)):

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“diffloop”)

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超文本标记语言 R脚本 diffloop:从染色质拓扑数据中识别差异DNA环。
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文本 许可证

细节

biocViews DataImportDataRepresentation预处理质量控制软件可视化
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证 MIT +文件许可
取决于
进口 方法,GenomicRangesforeachplyrdplyrreshape2ggplot2matrixStats寿司刨边机locfitstatmodbiomaRtGenomeInfoDbS4VectorsIRanges, grDevices,图形,统计,utils,Biobasereadrdata.tablertracklayerpbapplylimma
链接
建议 DESeq2diffloopdataggrepelknitrrmarkdowntestthat
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增强了
URL https://github.com/aryeelab/diffloop
BugReports https://github.com/aryeelab/diffloop/issues
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源包 diffloop_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 diffloop_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) diffloop_1.6.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffloop
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/diffloop/
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