derfinderPlot

DOI:10.18129 / B9.bioc.derfinderPlot

绘图函数derfinder

Bioconductor版本:版本(3.6)

这个包提供了绘图函数结果derfinder包。

作者:达芬奇Collado-Torres (aut (cre),杰弗里·t·安德鲁·e·贾菲(aut)韭菜(aut,黑色)

维护人员:达芬奇Collado-Torres < lcollado jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“derfinderPlot”)

文档

HTML	R脚本	介绍derfinderPlot
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,RNASeq,测序,软件,可视化
版本	1.12.3
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.2)
进口	derfinder(> = 1.1.0),GenomeInfoDb(> = 1.3.3),GenomicFeatures,GenomicRanges(> = 1.17.40),ggbio(> = 1.13.13),ggplot2、图形、grDevicesIRanges(> = 1.99.28),limma、方法、plyr,RColorBrewer,reshape2,S4Vectors(> = 0.9.38),尺度,跑龙套
链接
建议	biovizBase,bumphunter(> = 1.7.6),derfinderData(> = 0.99.0),devtools(> = 1.6),knitcitations(> = 1.0.1),knitr(> = 1.6),BiocStyle(> = 2.5.19),org.Hs.eg.db,rmarkdown(> = 0.3.3),testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/leekgroup/derfinderPlot
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/derfinderPlot
取决于我
进口我
建议我	derfinder,regionReport
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	derfinderPlot_1.12.3.tar.gz
Windows二进制	derfinderPlot_1.12.3.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	derfinderPlot_1.12.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/derfinderPlot
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/derfinderPlot/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.6源码包	源存档