dSimer

DOI:10.18129 / B9.bioc.dSimer

疾病相似度方法的整合

Bioconductor版本:Release (3.6)

dSimer是一个R包，它提供了9种度量疾病相似度的方法的计算，包括一个标准余弦相似度度量和8种基于函数的方法。这9种方法得到的疾病相似度矩阵可以通过热图和网络进行可视化。dSimer还提供了广泛用于疾病-疾病关联研究的生物学数据。

作者:李敏<丽敏at mail.csu.edu.cn>，倪鹏，费志辉、黄萍投稿。

维护者:彭妮

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“dSimer”)

文档

超文本标记语言	R脚本	疾病相似度方法的整合
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	网络，软件，可视化
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.3.0)，igraph(> = 1.0.1)
进口	统计数据,Rcpp(> = 0.11.3),ggplot2，reshape2，GO.db，org.Hs.eg.db，AnnotationDbi、图形
链接	Rcpp
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	dSimer_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	dSimer_1.4.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	dSimer_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dSimer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/dSimer/
软件包下载报告	下载数据