CSAW
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doi：10.18129/b9.bioc.csaw
用窗户分析的芯片序列分析
生物导体版本：版本（3.6）
通过滑动窗口检测芯片序列数据中的差异结合区域，并采用标准化和适当的FDR控制方法。
作者：aaron lun
维护者：aaron lun
引用（从r内，输入引用（“ CSAW”））：
安装
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文档
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| CSAW小插图 | ||
| csawuserguide.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，差异词，，，，遗传学，，，，多重组合，，，，正常化，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（3.5岁） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.4），基因组机，，，，总结性特征（> = 1.2.0），生物比较 |
| 进口 | rsamtools，，，，EDGER，，，，林玛，，，，GenomicFeatures，，，，AnnotationDbi， 方法，S4VECTORS，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，生物基因，，，，Rhtslib，统计RCPP |
| 链接 | Rhtslib，，，，Zlibbioc，，，，RCPP |
| 建议 | org.mm.eg.db，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene |
| 系统要求 | C ++ 11 |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | Diffhic，，，，瓦肯 |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | csaw_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | csaw_1.12.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | csaw_1.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/csaw |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/csaw/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
