杂交

doi：10.18129/b9.bioc.crossmeta

微阵列数据的跨平台荟萃分析

生物导体版本：版本（3.6）

实施Affymentrix，Illumina和Agilent微阵列数据的跨平台和跨物种荟萃分析。该软件包可以自动执行常见任务，例如下载，正常化和注释RAW GEO数据。然后，用户选择控制和治疗样本，以便对所有比较进行差分表达/途径分析。分别分析每个对比度后，用户可以为每个对比度选择组织源，并指定应为随后的荟萃分析分组的任何组织源。最后，效应大小和途径荟萃分析可以进行，并以图形方式探索了结果。

作者：亚历克斯·皮克林

维护者：Alex Pickering

安装

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##尝试http：//如果不支持https：// URL不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ crossmeta”）

文档

html	R脚本	十字架小插图
PDF		参考手册
文本		执照

细节

生物浏览	注解，，，，批处理效应，，，，差异性，，，，GUI，，，，基因表达，，，，微阵列，，，，Onechannel，，，，预处理，，，，软件，，，，组织血液阵列，，，，转录
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（1。5年）
执照	麻省理工学院 +文件许可证
要看	R（> = 3.3）
进口	副词（> = 1.52.0），affxparser（> = 1.46.0），AnnotationDbi（> = 1.36.2），生物酶（> = 2.34.0），生物基因（> = 0.20.0），Biocinstaller（> = 1.24.0），CCMAP，，，，DT（> = 0.2），Data.Table（> = 1.10.4），多帕尔（> = 1.0.10），Dorng（> = 1.6），fdrtool（> = 1.2.15），foreach（> = 1.4.3），GGPLOT2（> = 2.2.1），地球（> = 2.40.0），林玛（> = 3.30.13），矩阵（> = 0.51.0），元（> = 3.1.2），代码（> = 0.8），miniui（> = 0.1.1），奥利戈（> = 1.38.0），潘德（> = 0.6.0），情节（> = 4.5.6），重塑（> = 0.8.6），rcolorbrewer（> = 1.1.2），rdrop2（> = 0.7.0），Stringr（> = 1.2.0），SVA（> = 3.22.0），闪亮的（> = 1.0.0），Stats（> = 3.3.3）
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，Lydata，，，，org.hs.eg.db，，，，测试，，，，CCDATA
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	CCMAP
构建报告

包装档案

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源包	crossmeta_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	crossmeta_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	crossmeta_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crossmeta
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/crossmeta/
软件包下载报告	下载统计