Bioconductor版本:Release (3.6)
cosmiq是一种用于液相色谱或气相色谱质谱(LCMS/GCMS)数据预处理的工具,专注于代谢组学或脂质组学应用。为了提高对低丰度信号的检测,cosmiq在应用峰值检测算法之前,从所有获得的运行中生成mZ/RT空间的主地图。与分别在每个LCMS/GCMS文件中进行峰值拾取的传统方法相比,其结果是对低强度MS信号进行更可靠的识别和量化。cosmiq包构建在xcmsSet对象结构之上,因此可以作为备选预处理步骤与包xcms很好地集成。
作者:David Fischer
维护者:David Fischer
引文(从R内,输入引用(“cosmiq”)
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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cosmiq”)
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browseVignettes(“cosmiq”)
R脚本 | 代谢组学学会第十三届年会2017海报P-32 | |
R脚本 | cosmiq底漆 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | MassSpectrometry,代谢组学,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(3.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.0.2),Rcpp |
进口 | pracma,xcms,MassSpecWavelet,faahKO |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/devel/bioc/html/cosmiq.html |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | cosmiq_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | cosmiq_1.12.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | cosmiq_1.12.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cosmiq |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cosmiq/ |
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