cosmiq

DOI:10.18129 / B9.bioc.cosmiq

cosmiq -将单个质量组合成数量

Bioconductor版本:Release (3.6)

cosmiq是一种用于液相色谱或气相色谱质谱(LCMS/GCMS)数据预处理的工具，专注于代谢组学或脂质组学应用。为了提高对低丰度信号的检测，cosmiq在应用峰值检测算法之前，从所有获得的运行中生成mZ/RT空间的主地图。与分别在每个LCMS/GCMS文件中进行峰值拾取的传统方法相比，其结果是对低强度MS信号进行更可靠的识别和量化。cosmiq包构建在xcmsSet对象结构之上，因此可以作为备选预处理步骤与包xcms很好地集成。

作者:David Fischer ， Christian Panse ， Endre Laczko < Endre。Laczko在fgcz.uzh.ch>

维护者:David Fischer ， Christian Panse

安装

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文档

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PDF	R脚本	代谢组学学会第十三届年会2017海报P-32
PDF	R脚本	cosmiq底漆
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	MassSpectrometry，代谢组学，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.0.2)，Rcpp
进口	pracma，xcms，MassSpecWavelet，faahKO
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/devel/bioc/html/cosmiq.html
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cosmiq_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	cosmiq_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	cosmiq_1.12.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cosmiq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cosmiq/
软件包下载报告	下载数据