coseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.coseq

测序数据的共表达分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

高通量测序数据中表达谱的共表达分析。使用自适应转换和混合模型或K-means算法对特征(例如基因)轮廓进行聚类，并提供模型选择标准(选择适当数量的聚类)。

作者:Andrea Rau, Cathy Maugis-Rabusseau, Antoine godichonbaggioni

维护者:Andrea Rau < Andrea。Rau在jouy.inra.fr>

安装

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文档

超文本标记语言	R脚本	coseq
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，RNASeq，测序，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(1年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (>= 3.4.1)，SummarizedExperiment，S4Vectors
进口	刨边机，DESeq2，capushe，Rmixmod，e1071，BiocParallel，ggplot2(> =魅惑,尺度，HTSFilter，corrplot，HTSCluster(> = 2.0.8),gridExtra， grDevices，图形，统计，方法，作文，mvtnorm
链接
建议	Biobase，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
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包档案

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源包	coseq_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	coseq_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	coseq_1.2.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/coseq/
软件包下载报告	下载数据